也许对促排卵药物更有争议的是它们与激素依赖性癌症的相关性,如卵巢、乳腺和内膜癌。有许多报道支持或否定这种可疑的相关性。大部分公布的数据提示生殖药物与这些癌症间的因果关系是回顾性的流行病学研究得出的,许多还指出他们的研究患者病例数以及其他因素,如回忆的偏差。还有确定合适的对照组的问题。因为这些药物应用频繁,潜在的风险尚未知,进一步的研究应更准确的确定生殖药物与激素依赖癌症的关系。
乳腺癌是发达国家妇女更常见的恶性肿瘤,在美国,一生中发生乳腺癌的可能是12.5%。几个meta分析显示近期口服避孕药和长期激素治疗可能轻微增加乳腺癌的风险。人们对生殖药物的关注增加,生殖药物可迅速升高雌激素的水平,也可能增加乳腺癌的风险。
许多研究针对这个问题而进行的,一项澳大利亚的研究发现行IVF治疗的患者在开始的1年内乳腺癌和子宫癌的风险增加。但整个的发病率并不比预期高。同样,意大利北部的病例对照研究没有发生殖药物治疗和乳腺癌风险间有任何联系。另一近期的meta分析显示不管是不孕还是应用药物治疗不孕都与乳腺癌风险增加有关。
使患者容易发生子宫内膜癌的风险的因素可能与不孕有关,如多囊卵巢综合症和雌激素化的无排卵,几个已发表的研究试图找到生殖药物和内膜癌的发展之间的关联,Modan等发现与未接受治疗的患者相比,接受治疗者内膜癌的发病率增高,但无统计学意义。